EDUARDO SOUSA VARELA - Portfólio Bionorte

Instituição/SIGLA
EMBRAPA PESCA E AQUICULTURA/CNPASA

Endereço: Prolongamento da Avenida NS 10, cruzamento com a Avenida LO 18, sentido Norte, loteamento Água Fria, Palmas (TO).Caixa Postal Nº 90, CEP: 77.008-900

E-mail: EDUARDO.VARELA@EMBRAPA.BR

Telefones: (63 ) 32297867

Linhas de pesquisa em que atua:
Conservação e uso Sustentável da Biodiversidade
Bioprospecção e Desenvolvimento de Bioprocessos e Bioprodutos

O Laboratório de Biotecnologia da Embrapa Pesca e Aquicultura é uma referência em pesquisas genômicas voltadas para espécies aquícolas, com ênfase especial nas espécies amazônicas. Nossa equipe é especializada em diversas áreas de ponta, incluindo edição gênica, estudos de expressão gênica, genômica de single cell, transcriptômica e o desenvolvimento de marcadores moleculares.
Contamos com uma infraestrutura moderna e equipada com tecnologias de última geração em biologia molecular, como sistemas de sequenciamento de nova geração (NGS), qPCRs de alta precisão, sequenciadores avançados, entre outros equipamentos que permitem a realização de pesquisas de alta complexidade e impacto.
Nosso laboratório está fortemente interessado em estabelecer parcerias internacionais que ampliem as fronteiras do conhecimento e promovam a inovação na biotecnologia aquática. Acreditamos que a colaboração com instituições globais é essencial para a compreensão aprofundada e conservação das espécies aquáticas da Amazônia, uma das regiões mais biodiversas do planeta.
Estamos comprometidos com o avanço científico e com a aplicação de nossas descobertas para promover a sustentabilidade e a conservação dos recursos aquáticos, sempre buscando novas parcerias que compartilhem nossa visão e valores.
The Biotechnology Laboratory from Embrapa Fisheries and Aquaculture is a leading center for genomic research focused on aquatic species, with a special emphasis on Amazonian species. Our team specializes in cutting-edge areas such as gene editing, gene expression studies, single-cell genomics, transcriptomics, and the development of molecular markers.
We are equipped with state-of-the-art molecular biology technologies, including next-generation sequencing (NGS) systems, high-precision qPCRs, advanced sequencers, and other equipment that enable high-complexity and impactful research.
Our laboratory is strongly interested in establishing international partnerships that expand the boundaries of knowledge and promote innovation in aquatic biotechnology. We believe that collaboration with global institutions is essential for a deeper understanding and conservation of Amazonian aquatic species, one of the most biodiverse regions on the planet.
We are committed to scientific advancement and the application of our discoveries to promote the sustainability and conservation of aquatic resources, always seeking new partnerships that share our vision and values.

Nome do Laboratório: LABORATÓRIO DE BIOTECNOLOGIA

Sigla: BLOCO K

Página Internet: WWW.CNPASA.EMBRAPA.BR

Telefones: (63) 32297867

Descrição dos recursos laboratoriais disponíveis:
1. PC-100 MICROPIPETTE PULLER: Este equipamento é usado para confeccionar microagulhas customizadas, que são essenciais para microinjeção em diversas espécies de peixes. Essas microagulhas são utilizadas principalmente em experimentos de microinjeção, como a introdução de material genético em embriões de peixe, um processo vital para estudos de genética e desenvolvimento embrionário.
2. FEMTOJET: O FemtoJet é um microinjetor programável com suprimento de pressão integrado, ideal para microinjeção semi-automática em experimentos de alto rendimento. Ele é utilizado em experimentos de edição genética, como a introdução de CRISPR/Cas9 em embriões de peixe, permitindo controle preciso sobre o volume de injeção e a pressão, garantindo a eficácia dos procedimentos de microinjeção.
3. CABINE DE SEGURANÇA CLASSE II A2: Este equipamento oferece um ambiente seguro para trabalhar com materiais biológicos, protegendo tanto o operador quanto a amostra de contaminações. Equipado com filtros HEPA H14, é crucial em laboratórios que manipulam culturas celulares ou realizam experimentos com organismos geneticamente modificados, garantindo que as condições estéreis sejam mantidas durante os experimentos com peixes.
4. Sistema de hibridização em lâminas – SlideCycler: Este sistema é utilizado para a ciclagem de temperatura em processos de desnaturação e hibridização em lâminas, essenciais para a realização de experimentos de hibridização in situ, como a detecção de sequências de RNA ou DNA específicas em amostras de tecido de peixe.
5. Sequenciador de Bancada Sanger ABI 3500: Este sequenciador é utilizado para realizar o sequenciamento de amplicons, especialmente aqueles editados por técnicas como CRISPR/Cas9. Na biotecnologia de peixes, é essencial para confirmar a edição genética em experimentos de manipulação de genomas.
6. Sequenciador NGS Promethion de alto rendimento da Nanopore: Um sequenciador de última geração utilizado para o sequenciamento massivo paralelo de genomas inteiros. Na biotecnologia de peixes, permite o estudo aprofundado de genomas complexos e a identificação de mutações e variantes genéticas em larga escala.
7. Sequenciador NGS portátil Minion da Nanopore: Este é um sequenciador portátil de NGS, ideal para trabalhos de campo ou laboratórios que precisam de mobilidade. É utilizado para sequenciamento rápido e eficiente de DNA e RNA em amostras de peixe, facilitando a pesquisa genética em ambientes diversos.
8. Termociclador convencional Veriti: Um termociclador utilizado para amplificação de DNA através da reação em cadeia da polimerase (PCR). Essencial para experimentos que requerem a amplificação de sequências específicas de DNA em estudos de genética de peixes.
9. Termociclador de PCR em tempo real STEPONEPLUS: Este equipamento é utilizado para quantificar DNA em tempo real durante o processo de PCR. Na biotecnologia de peixes, é empregado em estudos de expressão gênica e quantificação de transcritos específicos em amostras de RNA.
10. Termociclador de PCR em tempo real QS7: Similar ao StepOnePlus, porém com uma capacidade maior (384 poços), permitindo a realização de experimentos de PCR em tempo real em larga escala, ideal para estudos de expressão gênica em grandes populações de peixes.
11. Estereomicroscopio para microinjeção trinocular 50x: Um microscópio utilizado para visualizar amostras de embriões de peixe durante microinjeções. Sua iluminação e capacidade de ampliação permitem a realização precisa de procedimentos delicados como a injeção de material genético.
12. Microscópio de fluorescência de campo claro: Este microscópio é utilizado para visualizar amostras que foram marcadas com fluoróforos. Na biotecnologia de peixes, é essencial para a análise de tecidos ou células, especialmente em estudos de expressão gênica e marcação de proteínas.
13. Microcentrífugas ventiladas e refrigeradas: Equipamentos usados para a centrifugação de amostras biológicas a baixas temperaturas, preservando a integridade dos componentes celulares ou moleculares. São essenciais em processos de separação e purificação de ácidos nucleicos, proteínas e outras biomoléculas em estudos com peixes.
14. Ultrafreezer, freezer científico e refrigeradores: Estes equipamentos são usados para a conservação de amostras biológicas, como tecidos, células e reagentes, a baixas temperaturas. Na biotecnologia de peixes, são fundamentais para o armazenamento de amostras genéticas e outras substâncias sensíveis.
15. Microtomo para parafina e resinas: Utilizado para preparar cortes finos de tecidos embebidos em parafina ou resinas, que são posteriormente analisados em microscopia. Essencial para a realização de estudos histológicos em peixes, permitindo a análise detalhada de estruturas celulares e teciduais.
16. Leitora de placa multimodal para fluorescência, bioluminescência e absorbância: Este equipamento é utilizado para a quantificação de reações bioquímicas em placas de microtitulação. Na biotecnologia de peixes, é aplicado em ensaios de viabilidade celular, expressão gênica e outras análises baseadas em fluorescência ou bioluminescência.
17. Espectrofotômetro Nanodrop: Um dispositivo usado para a quantificação e verificação da pureza de ácidos nucleicos e proteínas. Na biotecnologia de peixes, é essencial para garantir a qualidade das amostras de DNA e RNA antes de análises posteriores, como sequenciamento ou PCR.
18. Fluorômetro Qubit: Utilizado para quantificação precisa de DNA e RNA, é essencial em experimentos onde a quantificação exata de material genético é crucial, como na preparação de bibliotecas para sequenciamento.
19. Sistema de microfluido TAPESTATION: Este sistema é utilizado para controle de qualidade de DNA e RNA, proporcionando uma análise rápida e precisa da integridade das amostras, crucial para garantir o sucesso de experimentos de sequenciamento e outras aplicações genômicas.
20. Sistema de incubadora de ovos e larvas de peixes em RAS: Um sistema de Recirculação de Aquacultura (RAS) com controle de qualidade da água, essencial para a incubação de ovos e o desenvolvimento de larvas de peixes em condições controladas. Ele permite o estudo de fatores que afetam o crescimento e o desenvolvimento inicial dos peixes.
21. Contadores automatizados de células com filtro de fluorescência: Estes contadores utilizam inteligência artificial para verificar a viabilidade de células e núcleos, permitindo uma análise rápida e precisa em experimentos de cultura celular e manipulação genética de peixes.
22. Microcentrífugas tipo minispin: Pequenas centrífugas utilizadas para a rápida separação de componentes em pequenas amostras. São utilizadas em diversas etapas de preparo de amostras para análises moleculares em biotecnologia de peixes.
23. Agitadores orbitais, 369 graus e vórtex: Utilizados para misturar soluções e suspensões em laboratório, são essenciais para garantir a homogeneidade em soluções de reagentes ou culturas celulares durante a preparação de experimentos.
24. Balanças analíticas e semi-analíticas: Equipamentos de alta precisão para a pesagem de reagentes e amostras biológicas. Na biotecnologia de peixes, são usadas para preparar soluções com precisão, garantindo a exatidão dos experimentos.
25. Disruptor de tecidos e células: Um equipamento usado para a quebra mecânica de células e tecidos, liberando ácidos nucleicos e proteínas para análises subsequentes. É fundamental em experimentos de extração de DNA, RNA e proteínas em biotecnologia de peixes.